Programme

 --------------------------------

Pré-programme en cours de construction

Pour les sessions de hackathon, trois axes principaux sont proposés :

• Développement/amélioration d’outils Galaxy - à partir de scripts, de jupyter notebooks ou d’applications interactive;
• Création/amélioration de workflows Galaxy;
• Développement/amélioration de tutoriels Galaxy

 --------------------------------

Lundi 15 septembre 2025

• 18h30 - 19h30 : conférence introductive

  • Utilisation de la plateforme Galaxy pour les sciences du système Terre-environnement : Point d’étape et perspectives par Marie Jossé (CNRS, Data Terra) & Yvan Le Bras (MNHN, PNDB-DataTerra)
• 20h00 - ....?.... : soirée conviviale [lieux à définir]

Mardi 16 septembre 2025

• 09h30 - 10h00 : Accueil
• 10h00 - 10h40 : tour de table / présentation / programme
• 11h40 - 12h30 : Création de groupes
• 12h30 - 14h00 : repas
• 14h00 - 17h30 : Hackathon session 1
• 17h30 - 18h00 : synthèse de la session 1 (Partage en commun des sujets, démarrages, interrogations, problématiques)

Mercredi 17 septembre 2025

• 09h00 - 12h00 : Hackathon session 2
• 12h00 - 12h30 : synthèse de la session 2 (Partage en commun des sujets, démarrages, interrogations, problématiques)
• 12h30 - 14h00 : repas
• 14h00 - 17h30 : Hackathon session 3
• 17h30 - 18h00 : synthèse de la session 3 (Partage en commun des sujets, démarrages, interrogations, problématiques)

Jeudi 18 septembre 2025

• 09h30 - 11h30 : Formations Par Nicolas Casajus data scientist à la FRB CESAB, et équipe PNDB :

• • Formation introductive aux principes FAIR (Facile à trouver, Accessible, Intéropérable, Réutilisable)
  • Formation à Galaxy (Galaxy-ecology & Galaxy-earth system)
  • Formation introductive GitHub / GitLab
  • Formation introductive R Shiny
  • Formation introductive reproductibilité via research compendium

• 11h30 - 12h30 : synthèse des journées et actions à programmer
• 12h30 - 13h30 : repas